Corrupción de archivos en la sd

Esto no se si debería ir aquí
He estado de viaje hace poco y a la vuelta me he encontrado que al copiar las fotos desde la sd, muchas dan errores de e/s, tanto intentando utilizar ubuntu como windows, pero lo mas extraño de todo es que me deja perfectamente tanto ver las fotos como editarlas, y no veo que tengan mas problemas que mi calidad como fotógrafo
, ¿hay alguna manera de arreglarlo que no implique por ejemplo irlas abriendo una a una con gimp u otra cosa e irlas guardando de nuevo? He intentado usar la reparación automática de windows, usar recuva , que me los recupera con el mismo error, y también el testdisk de linux, pero me encuentra error en los ¿sectores? y ¿cilindros? y me decía que arreglara a mano con la opción de ¿geometría? y no me fio de mis escasos conocimientos. Creo, por lo que he investigado, que lo que habría que hacer es regenerar el árbol de directorios, pero no se hacerlo ni se como buscar como.
También, ¿se puede formatear las tarjetas en otro tipo de partición que no sea FAT? porque entiendo que el culpable de estas cosas es el sistemas de archivos FAT, he probado con EXFAT pero mi GX7 no lo lee. Si nadie sabe un día me pongo a probar tipos de partición desde ubuntu a ver si alguno vale.

He estado de viaje hace poco y a la vuelta me he encontrado que al copiar las fotos desde la sd, muchas dan errores de e/s, tanto intentando utilizar ubuntu como windows, pero lo mas extraño de todo es que me deja perfectamente tanto ver las fotos como editarlas, y no veo que tengan mas problemas que mi calidad como fotógrafo

También, ¿se puede formatear las tarjetas en otro tipo de partición que no sea FAT? porque entiendo que el culpable de estas cosas es el sistemas de archivos FAT, he probado con EXFAT pero mi GX7 no lo lee. Si nadie sabe un día me pongo a probar tipos de partición desde ubuntu a ver si alguno vale.